Nagate Tanikaze

O protagonista principal da série. Apesar de ter dificuldades para se adaptar ao modo de vida de Sidonia e constantemente se meter em problemas enquanto é rejeitado por outros humanos devido à sua falta de conhecimento sobre as leis e atributos da nova cultura, ele acaba se tornando o salvador da população da nave, seu principal defensor e herói ao longo do tempo. Ele pilota um modelo de mecha Guardian mais antigo, mas capaz, chamado "Tsugumori." Ao contrário da maioria dos sidonianos que foram geneticamente modificados para ter a capacidade de receber a maior parte de suas necessidades energéticas através da fotossíntese e precisam consumir comida apenas uma vez por dia, ele é um humano puro que precisa consumir quantidades adequadas de alimentos para satisfazer suas necessidades de energia e nutrição.