Makoto Shishio

Após a morte de Yukishiro Tomoe, Himura Kenshin se tornou um espadachim livre para proteger os membros do Ishin Shishi. Shishio Makoto se tornou seu sucessor como o hitokiri sombra (assassino) e foi responsável pelo assassinato de Izuka, o homem que havia traído o shishi. O futuro governo Meiji era mais reservado em relação a Shishio do que Kenshin; muitos membros dos clãs Chōshū e Satsuma (os membros do futuro governo Meiji) teriam muito pouca informação sobre ele. Mais tarde, o novo governo Meiji acreditou que seria do seu melhor interesse eliminar Shishio antes que ele se tornasse muito poderoso, já que Shishio era um homem que desejava poder. Assim, durante a Guerra Boshin, Shishio foi deixado inconsciente por vários tiros, ensopado em óleo e queimado vivo pelo novo governo formado pelo Ishin Shishi. Ele sobreviveu, sofrendo danos severos em todo o seu corpo. Depois, ele reuniu um grupo dos melhores lutadores do Japão, chamado Juppongatana (Dez Espadas), para derrubar o governo Meiji. Shishio imaginou um Japão governado por ele, impondo os princípios da seleção natural, ou o que ele chamava de "os fortes comem os fracos". Usando essa crença, ele conduziu uma campanha contra o governo Meiji, pois achava que era fraco demais para liderar o país de forma eficaz. Usando seu lema, ele moldou um discípulo ideológico a partir de Seta Sōjirō, que serviu como seu braço direito e o mais forte dos Juppongatana. Ele planejava fortalecer a economia com petróleo assim que assumisse o país.