Jin Kunugi

O Coronel Kunugi é o Comandante da TERRA. Ele é um homem assombrado por seu passado; durante a Primeira Guerra Mu, ele foi diretamente responsável pela morte de sua filha. Sua esposa se divorciou dele. Kunugi é incomumente amigável com seus subordinados e tolerante com Ayato; ele é amigo de muitas pessoas influentes no projeto RahXephon, incluindo o Professor. Ele também vê Quon como uma espécie de substituta da filha. Mesmo assim, suas ações passadas o instigam a buscar redenção e ele não quer repetir seus erros.