No futuro próximo, a Terra está em guerra com alienígenas chamados Vermes. A guerra deixa a população terrestre dizimada, e os jovens são as principais vítimas. Os Vermes foram derrotados, mas o seu reaparecimento sinaliza a criação de uma unidade de meca chamada Sonic Divers, pilotada por 3 jovens garotas para combater essa ameaça.