Quando criança, Riki Naoe se fechou para o mundo após receber um diagnóstico de narcolepsia devido à morte trágica de seus pais. No entanto, Riki é salvo quando, em um dia decisivo, um garoto chamado Kyousuke o recruta para um time que se autodenomina os Pequenos Vigaristas. Acompanhados por Masato, Kengo e Rin, esses desajustados passam a infância lutando contra o mal e aproveitando sua juventude.

Anos se passam e, mesmo na escola secundária, a equipe permanece unida e forte. Kyousuke decide reviver o grupo formando um time de beisebol, já que esse será seu último ano escolar com eles. Mas há um problema: não há membros suficientes! Agora, é a vez de Riki recrutar novos amigos para os Pequenos Vigaristas, assim como Kyousuke fez por ele.

Então, um presságio surge - Rin encontra uma estranha carta presa em seu gato, atribuindo-lhes a tarefa de descobrir o ""segredo deste mundo"" completando tarefas específicas. Qual é esse segredo e por que está sendo escondido? É tarefa dos Pequenos Vigaristas descobrir!