Novamente frustrados por Naraku, Inuyasha, Kagome Higurashi e seus amigos devem continuar sua busca pelos poucos fragmentos restantes da Joia de Shikon, para impedir que ela se forme completamente em uma joia corrompida nas mãos de Naraku. No entanto, Naraku tem planos próprios para adquiri-los e destruirá qualquer pessoa ou coisa que esteja em seu caminho - até mesmo seus próprios subordinados.

A persistente e implacável ameaça representada por Naraku força Sango e Miroku a decidir o que é mais importante para eles - um ao outro ou seu dever na batalha. Enquanto isso, Inuyasha deve decidir se seu coração pertence a Kikyou ou Kagome, antes que o destino decida por ele. Em meio à corrida para encontrar os fragmentos, Inuyasha e seu irmão Sesshoumaru também devem resolver sua disputa e cooperar para sua confrontação final com Naraku, pois é uma batalha que devem vencer para acabar com seu mal e crueldade de uma vez por todas.