Pelos últimos 500 anos, o Imperador Tabu, Arthur Gaz, governou o Império Gaz com punho de ferro e conduziu experimentos desumanos em seu próprio povo. Mas seu reinado chegou ao fim cinco anos atrás, quando guerreiros poderosos - mais tarde conhecidos como os Oito Heróis - o derrotaram em uma batalha pela capital. Sua morte encerrou a guerra de 300 anos entre o Império Gaz e a aliança de seis nações.

Nos dias atuais, Tooru Acura é um ex-sabotador da guerra que tem dificuldade em se adaptar ao mundo pacífico, pois não consegue encontrar um emprego onde possa colocar suas habilidades de luta em uso. Uma oportunidade aparece diante dele, no entanto, quando ele conhece uma bruxa de cabelos brancos chamada Chaika Trabant. Com um caixão nas costas, ela está procurando pelos restos espalhados de seu pai para dar a ele um enterro adequado, e ela contrata Tooru e sua irmã adotiva Akari para ajudá-la. No entanto, a aliança das seis nações, que agora formaram o Conselho das Seis Nações, envia Albéric Gillette e seus homens da Agência Kleeman para perseguir e prender a filha do falecido Imperador Gaz - Chaika.

Com a revelação chocante da identidade de Chaika, os irmãos Acura devem escolher entre ajudá-la a reunir os restos do imperador tirânico e manter a paz que o continente luta para manter.