Gintoki, Shinpachi e Kagura retornam como membros divertidos, mas falidos da equipe Yorozuya! Vivendo em uma Edo de realidade alternativa, onde espadas são proibidas e os senhores alienígenas conquistaram o Japão, eles tentam prosperar fazendo qualquer trabalho que consigam. No entanto, Shinpachi e Kagura ainda não foram pagos... Gin-chan realmente gasta todo aquele dinheiro jogando pachinko?

Enquanto isso, quando Gintoki volta para casa bêbado uma noite, uma nave espacial alienígena cai nas proximidades. Um membro da tripulação fatalmente ferido emerge da nave e dá a Gintoki um dispositivo estranho em forma de relógio, avisando que ele é incrivelmente poderoso e deve ser protegido. Confundindo-o com seu despertador, Gintoki acaba quebrando o dispositivo na manhã seguinte e de repente descobre que o mundo fora de seu apartamento parou. Com Kagura e Shinpachi ao seu lado, ele parte para consertar o dispositivo; no entanto, como sempre, nada é tão simples para a equipe Yorozuya.

Cheia de humor irônico e momentos sinceros de emoção, a quarta temporada de Gintama mostra Gintoki e seus amigos enfrentando tanto seus mais hilários contratempos quanto suas crises mais perigosas até agora.