Yuugo Hachiken é estudioso, trabalhador e cansado de tentar viver de acordo com as expectativas que simplesmente não consegue alcançar. Com a chegada de um novo ano escolar, ele decide se inscrever na Escola Agrícola Ooezo, um internato localizado no campo de Hokkaido, como um meio de escapar do estresse causado por seus pais. Inicialmente convencido de que se sairia bem nessa instituição, Hachiken é rapidamente provado errado por seus colegas talentosos, indivíduos que vivem em fazendas suas vidas inteiras e conhecem tudo sobre comida, vegetais e até mesmo a fisiologia do gado! Seja acordando às cinco da manhã para trabalhos extenuantes ou cuidando de animais de fazenda, Hachiken é um completo amador quando se trata da dura vida agrícola.

Gin no Saji segue a história cômica de um jovem estudante enquanto ele tenta se encaixar em um ambiente completamente novo, conhecendo muitas pessoas únicas ao longo do caminho. Enquanto ele luta para apreciar seu ambiente, Hachiken espera descobrir seus sonhos, para que possa levar uma vida satisfatória em seus próprios termos.