A vida ordinária de Hajime Ichinose está prestes a mudar quando um ser transcendental chamado J.J Robinson entrega a ela um pequeno livro chamado NOTE - um dispositivo que a transforma em um dos Gatchaman, os lendários protetores da cidade de Tachikawa. Alertando que a existência do grupo deve permanecer em segredo, o colega Gatchaman Sugane Tachibana leva Hajime à sua base de operações, onde Paiman, o líder alienígena semelhante a um panda dos Gatchaman, revela seu propósito: eliminar alienígenas que representam perigo para a humanidade. Essas ameaças existenciais, chamadas MESS, estão se tornando cada vez mais perigosas, destruindo tudo o que tocam. Agora cabe aos Gatchaman e sua nova recruta detê-los antes que o mundo seja envolto pelo caos.