Uma jovem assassina taiwanesa com o codinome "Coração de Vidro" cometeu suicídio pulando de um prédio, e seu coração foi perfurado por uma cerca de metal. Milagrosamente, sua vida foi salva por um transplante de coração. Durante sua recuperação, ela começou a ter sonhos estranhos, que a levaram ao Japão em busca do doador de seu coração, que por acaso é Kaori Makimura, ex-parceira do City Hunter Ryo Saeba. O autor mencionou no primeiro volume do tankoubon que Angel Heart compartilha apenas os mesmos personagens de City Hunter, mas não sua continuação. Os eventos são todos de universo paralelo, portanto não tem nada a ver com City Hunter.